59 |
Citozina
Un exemplu simplu este cel al citozinei dat în cele ce urmează
HEADER
REMARK Spartan exported Wed Feb 11 21:41:38 1998
HETATM 1 C UNK 0001 -1.322 -0.018 -1.043
HETATM 2 N UNK 0001 -1.317 0.091 0.329
HETATM 3 C UNK 0001 -0.162 0.133 0.931
HETATM 4 C UNK 0001 1.154 0.067 0.228
HETATM 5 N UNK 0001 -0.186 0.237 2.295
HETATM 6 O UNK 0001 -2.359 -0.054 -1.691
HETATM 7 N UNK 0001 -0.135 -0.094 -1.723
HETATM 8 H UNK 0001 1.945 -0.093 -1.745
HETATM 9 H UNK 0001 -0.197 -0.151 -2.729
HETATM 10 C UNK 0001 1.075 -0.044 -1.100
HETATM 11 H UNK 0001 2.078 0.125 0.782
HETATM 12 H UNK 0001 0.540 -0.254 2.801
HETATM 13 H UNK 0001 -1.115 0.055 2.665
CONECT 1 7 6 2
CONECT 2 3 1
CONECT 3 2 4 5
CONECT 4 3 10 11
CONECT 5 3 12 13
CONECT 6 1
CONECT 7 1 10 9
CONECT 8 10
CONECT 10 7 4 8
CONECT 11 4
CONECT 12 5
CONECT 13 5
END
Imaginea 3D a citozinei (sub forma de BMP obţinută prin export din rasmol, sau sub forma jpg prin transformarea pdb în VRML vizualizat cu browser capturată imaginea cu screen save importată în MSPaint, prelucrată şi salvată în format jpeg. Observaţie: formatul bmp exportat din Rasmol este de dimensiune mică însă nu poate fi convertit în jpeg sau gif de către MSPaint) este
Fig. 2. Imagine 3D a citozinei. Fişier BMP obţinut prin export din Rasmol. |
Fig. 3. Imagine 3D a citozinei. Fişier JPEG obţinut prin transformarea PDB în VRML (cu programul pdb2vrml.exe. Fişierul cu extensia WRL obţinut astfel este vizualizat cu un browser MSIE. Imaginea 2D astfel obţinută este capturată cu funcţia screen save a Windows şi importată în MSPaint. Prelucrată în MSPaint şi apoi salvată în format JPEG. |
© Cornel Mironel Niculae, 2003-
12-Jan-2012